在我国历史上，黄花梨先后有多个不同的称呼，从留存下来的古代文献以及近现代相关著作中，可以看到黄花梨的诸多名字，如花榈、榈木、花梨、花梨木、老花梨、新花梨、黄花梨、海南檀、降香黄檀。
花榈（榈木）的称呼从唐一直影响至今
唐代陈藏器的《本草拾遗》称之为“榈木”；
明代的李时珍《本草纲目》、清代的屈大均《广东新语》称“花榈”；
李宗山先生所著《中国家具史图说》中说“花梨木亦称花榈木（OrmosiahenryiPrain）”。
花梨（花梨木、番花梨）的名称由宋至20世纪初
宋朝赵汝适《诸蕃志》、明朝黄省曾《西洋朝贡典录》，以及明、清的广东海南地方志均有“花梨”及“花梨木”的论述，清及民国海关关志进口商品名录中也采用“花梨”或“番花梨”。
老花梨、新花梨之说出现于清末至20世纪90年代初
清末及20世纪90年代初，有老花梨及新花梨之说。1944年出版的德国学者艾克的《中国花梨家具图考》中，认为中国家具中所使用的“高级花梨木”可分为：黄花梨——“它包括优美的明代和清初家具的黄花梨”；老花梨——“在较晚时期，特别是19世纪初叶的简朴家具中常用的、幽暗的褐色黄色老花梨”；新花梨——“实际属于红木群的新花梨”。新花梨成为近代行业俗称，指产自越南的香枝木。黄花梨名称的使用从民国初期至今。
“黄花梨”的说法究竟始于何时，历史文献中没有明确记载。20世纪初著名学者梁思成在考察古代建筑和研究明清家具时，发现明代所用“花梨”木与近代所用的“新花梨”并不是同一种木材，为了区别这两种相近而价值不同的木材，便将明代所用的“花梨”木加了一个“黄”字，从此“黄花梨”之名便流传开来。
1960年国家文物局《关于文物出口鉴定标准的几点意见》采用了“黄花梨”这一名称。艾克的《中国黄花梨家具图考》中也有谈及。从20世纪80年代开始，各种研究明清家具的论文、专著均有论述。在20世纪80年代，明式家具研究专家王世襄的《明式家具研究》将明式黄花梨家具推到了前所未有的崇高地位，引起投资、收藏黄花梨家具的热潮。
海南檀的名称从明代至20世纪80年代
黄省曾在《西洋朝贡典录》中认为花梨有两种：一种为“花榈”木，另一种是“海南檀”。
1956年出版的候宽昭《广州植物志》中介绍了一种产于海南岛的花梨，名为“海南檀”。
降香黄檀的名称从1980年使用至今
1980年出版林学家成俊卿的《中国热带及亚热带木材》，认为古时被称为“花梨”的植物，其学名应为“降香黄檀”，拉丁文学名为DalbergiaOdoriferaT.Chen。降香黄檀“为国产黄檀属中已知唯一心材明显的树种……心材红褐色至深红褐色，深浅不均匀，常杂有黑褐色条纹……边材灰黄褐色或浅黄褐色，心材区别明显。”
在林学家吴中伦的《中国森林》中也有对降香黄檀的说明。GB/T18107--2000《红木》国家标准中，将海南产的“花梨”木定为“降香黄檀”。
